生態學方法

此類方法主要是利用污染物引起的群落組成或結構變化及生態系統功能變化為指標監測環境污染狀況。在未受污染的地區，生態系統處于自然狀態，其功能與結構基本是穩定的。但是，當生態系統受到污染物的脅迫后，其物種組成可能發生變化：敏感物種消失，抗性物種增加，個別強抗性物種成為群落的優勢種。隨著結構的變化，生態系統功能也發生相應變化，包括能流（如種群和群落的生產率和核生化監測系統的輔助配套TQ-462KU呼吸率）、物質循環（如各種營養物質的生物地球化學循環）以及各種生態調節機制（如各種種間相互關系）的改變。生態系統結構與功能的變化可以用各種參數表述，而這些參數即可用作生物監測指標。

生理學方法

此類方法是利用污染物引起的生物個體行為、生長、發育以及各種生理變化為指標監測換金污染或變化狀況。在一定的濃度范圍內，污染物沒有致死作用和致病作用，但可能干擾機體某些生理功能，使其偏離正常狀態。例如，受到一定濃核生化監測系統的輔助配套TQ-462KU度污染物影響，動物的回避反應和游泳能力等行為反應，呼吸、耗氧量及生長率等生理反應或者酶活性和肝細胞的糖元轉化等生化反應可能發生變化。污染物干擾生理學過程的重要特征之一是在不表現出外觀損傷之前改變機體的生理代謝。